114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  84.32 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  80.97 
 
 		 293 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  80.28 
 
 		 289 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  34.78 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  34.42 
 
 		 512 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.68 
 
 		 435 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  37.7 
 
 		 546 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.86 
 
 		 439 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  32.21 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.34 
 
 		 451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  31.82 
 
 		 465 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  29.88 
 
 		 432 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  32.01 
 
 		 423 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  32.01 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  29.48 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  29.13 
 
 		 436 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 		 512 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  27.48 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  27.1 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.34 
 
 		 684 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.65 
 
 		 2413 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.99 
 
 		 961 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1402 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.19 
 
 		 693 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  25.88 
 
 		 985 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1037 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.81 
 
 		 789 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.35 
 
 		 685 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.55 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.34 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1032 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.15 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 798 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1877 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.47 
 
 		 489 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1141 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1493 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.26 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.1 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.57 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.44 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.08 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  24.72 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.97 
 
 		 464 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08765  activator of chitin synthase (Eurofung)  29.61 
 
 		 807 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.061785  normal  0.272195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.57 
 
 		 425 aa  52.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  27.17 
 
 		 731 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.61 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.06 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  29.69 
 
 		 185 aa  52.8  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.31 
 
 		 509 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.76 
 
 		 235 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 705 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  27.63 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.31 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  23.36 
 
 		 490 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  33.66 
 
 		 1200 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.95 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.64 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.69 
 
 		 552 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.32 
 
 		 528 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  29.22 
 
 		 509 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  29.22 
 
 		 509 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  29.2 
 
 		 1200 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.76 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  23.36 
 
 		 490 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  28.12 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.95 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.91 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.26 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  25.29 
 
 		 557 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35 
 
 		 1263 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  28.29 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  30.23 
 
 		 1078 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30.23 
 
 		 1044 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.01 
 
 		 392 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.52 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1002 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.47 
 
 		 811 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.77 
 
 		 359 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  32.69 
 
 		 978 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  25.73 
 
 		 399 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02680  protoplast regeneration and killer toxin resistance gene, putative  25.53 
 
 		 490 aa  45.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.732137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.13 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.22 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>