152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3863 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 439 aa  911    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  88.84 
 
 		 451 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  85.19 
 
 		 435 aa  750    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  52.06 
 
 		 520 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  52.06 
 
 		 520 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  45.35 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  44.32 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  46.71 
 
 		 454 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  52.82 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  48.54 
 
 		 372 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  38.25 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  36 
 
 		 546 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  42.64 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  45.17 
 
 		 512 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  32.14 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  30.71 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  31.39 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  33.81 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  32 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  30.91 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  31.43 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  29.39 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  28.34 
 
 		 318 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.55 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  30.24 
 
 		 985 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  41.05 
 
 		 961 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.82 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.37 
 
 		 684 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1402 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.62 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.38 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.49 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.34 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  32.82 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1493 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  24.39 
 
 		 831 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1002 aa  57  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.78 
 
 		 282 aa  57  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.55 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.16 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1037 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.57 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.28 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1877 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  25.97 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  38.2 
 
 		 680 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.97 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24 
 
 		 2413 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.01 
 
 		 241 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 321 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 976 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.58 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 		 523 aa  53.5  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.74 
 
 		 685 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  30.1 
 
 		 363 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  27.14 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  28.4 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0303  hypothetical protein  35.87 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.921307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1032 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 		 557 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0479  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.87 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237479  hitchhiker  0.0000406218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  38.37 
 
 		 213 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.37 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  22.58 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  30.5 
 
 		 221 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1281 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  35.09 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.46 
 
 		 232 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.48 
 
 		 528 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 		 1110 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  40.58 
 
 		 679 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 117 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 294 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  29.27 
 
 		 294 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.74 
 
 		 218 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  31.19 
 
 		 1200 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  31.19 
 
 		 1200 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 1261 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.28 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  36.76 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.9 
 
 		 693 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.99 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  31.53 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 		 798 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  30.53 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 		 255 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  33.03 
 
 		 219 aa  48.5  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>