83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4176 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  64.32 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  63.35 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  62.25 
 
 		 435 aa  534  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  70.79 
 
 		 345 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  45.22 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  44.98 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  30.42 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  31.68 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  31.15 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  30.47 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  33.56 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.81 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  32.62 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  30 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  32.28 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  30.59 
 
 		 289 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  31.05 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.46 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  30.35 
 
 		 289 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  31.31 
 
 		 293 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.59 
 
 		 831 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1493 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.93 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2413 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.95 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.89 
 
 		 693 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.11 
 
 		 961 aa  53.5  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.47 
 
 		 489 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.26 
 
 		 557 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.68 
 
 		 684 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1402 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 798 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1032 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26 
 
 		 789 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.49 
 
 		 305 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0479  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.86 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237479  hitchhiker  0.0000406218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0303  hypothetical protein  31.86 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.921307  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1037 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.77 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.9 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  26.47 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.97 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 		 528 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.28 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.81 
 
 		 839 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.3 
 
 		 318 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  27.23 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1281 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1423  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.34 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  26.36 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  29.7 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  27.5 
 
 		 913 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  32.63 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 763 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  28.93 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  22.51 
 
 		 245 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  29.47 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  30.3 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.53 
 
 		 865 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 705 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  43.14 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.89 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.89 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.78 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  24.6 
 
 		 850 aa  43.1  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 1910 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.9 
 
 		 343 aa  43.1  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>