279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1423 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1423  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 249 aa  477  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.56 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.54 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  48.28 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.56 
 
 		 789 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  43.59 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.79 
 
 		 1199 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  50.85 
 
 		 1242 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  50.91 
 
 		 731 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  52.73 
 
 		 1402 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.14 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.44 
 
 		 961 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.14 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  49.12 
 
 		 557 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.31 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  47.17 
 
 		 1493 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.79 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  47.92 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  46.55 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  45.45 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  49.12 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  32.62 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  46.43 
 
 		 831 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  48.15 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1796 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.64 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03445  chitin synthase activator (Chs3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05580)  36.36 
 
 		 723 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  43.4 
 
 		 552 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  44.44 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  47.37 
 
 		 376 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.2 
 
 		 684 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 		 528 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  50 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  45.45 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  40.82 
 
 		 971 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  42.59 
 
 		 685 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.73 
 
 		 2413 aa  53.1  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  46.43 
 
 		 359 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.35 
 
 		 490 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  49.02 
 
 		 1877 aa  52.8  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  44.83 
 
 		 373 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  54.17 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  49.02 
 
 		 448 aa  52.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  53.33 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  50 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 		 126 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  49.18 
 
 		 416 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.8 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0957  hypothetical protein  30.53 
 
 		 125 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  43.4 
 
 		 115 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 		 763 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  42.86 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  43.14 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.45 
 
 		 489 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  40.54 
 
 		 839 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  51.02 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.8 
 
 		 971 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  45.28 
 
 		 1200 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  55.56 
 
 		 490 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 1145 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  42.59 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  46.81 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  49.06 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  56.1 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  49.02 
 
 		 976 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 679 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.02 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  47.92 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 763 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 		 346 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  45.61 
 
 		 839 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1002 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  48.15 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 1110 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.41 
 
 		 392 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  26.32 
 
 		 478 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  26.12 
 
 		 373 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  46.94 
 
 		 1200 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1976  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.28 
 
 		 362 aa  49.7  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.200197  hitchhiker  0.000810628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  44.68 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  47.92 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  44.68 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 		 1910 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 		 865 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.18 
 
 		 193 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.35 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  26.52 
 
 		 3242 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  33.98 
 
 		 396 aa  49.7  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.62 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  37.88 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  41.82 
 
 		 365 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  33.98 
 
 		 591 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.67 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>