92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2591 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  81.75 
 
 
423 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  957    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  87.94 
 
 
423 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  89.87 
 
 
454 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  54.17 
 
 
548 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  52.27 
 
 
546 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  69.48 
 
 
512 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.32 
 
 
439 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.77 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.79 
 
 
435 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  49.52 
 
 
520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  49.52 
 
 
520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  47.1 
 
 
512 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  46.13 
 
 
372 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  30.42 
 
 
412 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  30.38 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  30.46 
 
 
432 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  29.82 
 
 
436 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
345 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  30.67 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  32.52 
 
 
293 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  29.77 
 
 
343 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  31.16 
 
 
289 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  31.82 
 
 
291 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
831 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.44 
 
 
961 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.5 
 
 
373 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.5 
 
 
684 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  28.79 
 
 
346 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.04 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.74 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.34 
 
 
1002 aa  57  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.89 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.33 
 
 
552 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.67 
 
 
1493 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.73 
 
 
2413 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
512 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  28.57 
 
 
357 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.93 
 
 
1037 aa  53.9  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
705 aa  53.5  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 
693 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.27 
 
 
789 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.42 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  24.9 
 
 
1402 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  27.32 
 
 
368 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.26 
 
 
264 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  25.12 
 
 
985 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 
509 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.41 
 
 
393 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 
509 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 
509 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.7 
 
 
363 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 
509 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
976 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.35 
 
 
329 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.05 
 
 
680 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.9 
 
 
321 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.28 
 
 
489 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
1032 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  27.32 
 
 
536 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
254 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
859 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
448 aa  47.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.37 
 
 
208 aa  47  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
664 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 
798 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.37 
 
 
278 aa  47  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.22 
 
 
315 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
890 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.44 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.84 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1358  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.59 
 
 
258 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177099  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 
860 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.32 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  26.76 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  29.09 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.63 
 
 
271 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.21 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  24.16 
 
 
366 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  31.31 
 
 
839 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  30.56 
 
 
1796 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  26.62 
 
 
231 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  32.22 
 
 
795 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  30.48 
 
 
185 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  30.39 
 
 
202 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  28.57 
 
 
679 aa  43.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.19 
 
 
1877 aa  43.1  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>