More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3565 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 418 aa  856    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  58.11 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.79 
 
 		 684 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1402 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.91 
 
 		 961 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.69 
 
 		 789 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  29.3 
 
 		 591 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.12 
 
 		 593 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1037 aa  103  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.53 
 
 		 831 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1032 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.76 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.3 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 976 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.21 
 
 		 680 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.86 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.86 
 
 		 490 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  25.92 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.47 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.65 
 
 		 685 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.58 
 
 		 528 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.2 
 
 		 380 aa  86.3  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.56 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  28.92 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.63 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.51 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.47 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.81 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1877 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1493 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.89 
 
 		 865 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  29.18 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.95 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.65 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.59 
 
 		 1078 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.31 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.26 
 
 		 232 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  26.59 
 
 		 1044 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 1430 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  32.11 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.66 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1134 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  25.34 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.85 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1002 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.11 
 
 		 2413 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.76 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  28.02 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.3 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.14 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  28.65 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.94 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  27.72 
 
 		 245 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.76 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  32.18 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  28.16 
 
 		 940 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.88 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  26.74 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  27.83 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1281 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.91 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.25 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  24.76 
 
 		 850 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.2 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  27.68 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1366 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.14 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  35.19 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.26 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  25.43 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.17 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  25.32 
 
 		 985 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  24.03 
 
 		 961 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.5 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  26.06 
 
 		 1200 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  28.5 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  24.75 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  24.64 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.28 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.01 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 599 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2484  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.48 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 798 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  28.73 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.21 
 
 		 890 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  28.41 
 
 		 839 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  23.31 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  26.6 
 
 		 246 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.73 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>