14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00395 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00395  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  939    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0399379  normal  0.95262 
 
 
-
 
NC_003296  RS05223  hypothetical protein  81.69 
 
 		 347 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05221  putative signal peptide protein  76.72 
 
 		 162 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  68.49 
 
 		 746 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  65 
 
 		 746 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  65.43 
 
 		 753 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44920  hypothetical protein  27.58 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01937  hypothetical protein  25.76 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01938  hypothetical protein  24.23 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01936  putative signal peptide protein  24.78 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6902  hypothetical protein  23.19 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.554831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0638  hypothetical protein  25.14 
 
 		 184 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  32.77 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  30.4 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>