13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05223 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05223  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  710    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00395  hypothetical protein  81.69 
 
 		 455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0399379  normal  0.95262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  64.1 
 
 		 746 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  61.73 
 
 		 746 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  60 
 
 		 753 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003296  RS01937  hypothetical protein  26.37 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01936  putative signal peptide protein  26.45 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01938  hypothetical protein  25.54 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44920  hypothetical protein  25.63 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0638  hypothetical protein  26.92 
 
 		 184 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6902  hypothetical protein  25.82 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.554831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  37.8 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  38.67 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>