94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4291 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4291  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 383 aa  727    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.68 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.13 
 
 		 209 aa  90.1  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.15 
 
 		 282 aa  87.8  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.73 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  30.39 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  31.79 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  25.39 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  27.23 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  27.04 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  21.98 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  28.22 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  31.82 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  23.12 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  23.26 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.41 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.98 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  31.9 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.17 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  28.22 
 
 		 169 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  32.72 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1402 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  26.04 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  25.52 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.4 
 
 		 961 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.5 
 
 		 859 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 252 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.58 
 
 		 971 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0946  Sel1 domain protein repeat-containing protein  21.23 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 971 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  27.42 
 
 		 161 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1032 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00810  ubiquitin-protein ligase Sel1/Ubx2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14690)  29.93 
 
 		 1121 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.188237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 976 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  30.86 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4244  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4267  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.48 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0418148  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.05 
 
 		 684 aa  51.2  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  31.45 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  24.3 
 
 		 789 aa  50.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 705 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  30.06 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0477  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 275 aa  49.7  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.535577  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  26.92 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.12 
 
 		 343 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  29.45 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.25 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.03 
 
 		 693 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.29 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  24.1 
 
 		 1044 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  23.16 
 
 		 235 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  32.26 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  24.1 
 
 		 1078 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0694  Sel1 domain-containing protein  29.49 
 
 		 239 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55689  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2156  serine protease  28.45 
 
 		 134 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.178592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.68 
 
 		 1263 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  24.04 
 
 		 490 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  29.47 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  24.04 
 
 		 490 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  25.15 
 
 		 184 aa  46.6  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  22.67 
 
 		 1200 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  20.09 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 		 865 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  22.67 
 
 		 1200 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  27.87 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.24 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.86 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  32.26 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  23.04 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32976  predicted protein  26.88 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.682514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  29.31 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1720  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  25.43 
 
 		 831 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.84 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  29.27 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.24 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  24.88 
 
 		 232 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.18 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  32.26 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.35 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.02 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0695  Sel1 domain-containing protein  25.36 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.757899  normal  0.965019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.14 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.32 
 
 		 890 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.35 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  25.83 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>