74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1720 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1720  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.19 
 
 
209 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  32.89 
 
 
265 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  31.39 
 
 
209 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  31.71 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  35.85 
 
 
233 aa  55.1  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  34.57 
 
 
219 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.56 
 
 
264 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  41.27 
 
 
234 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  41.27 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
221 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  39.68 
 
 
234 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.32 
 
 
487 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.76 
 
 
271 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  33.77 
 
 
1078 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  25.5 
 
 
319 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  33.77 
 
 
1044 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.38 
 
 
684 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.89 
 
 
282 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2156  serine protease  29.2 
 
 
134 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.178592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.59 
 
 
272 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  28.12 
 
 
218 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  25 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.91 
 
 
490 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  26.79 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.45 
 
 
489 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  34.25 
 
 
1200 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.91 
 
 
490 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.26 
 
 
235 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.93 
 
 
254 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  30.3 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4291  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
383 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  26.37 
 
 
344 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  27.17 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4244  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.36 
 
 
373 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2038  molybdopterin biosynthesis protein  29.79 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.244571  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  26.19 
 
 
363 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.33 
 
 
1877 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  26.09 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.93 
 
 
1037 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 
722 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  34.25 
 
 
1200 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 
722 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 
722 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.72 
 
 
273 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  27.73 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 
722 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.06 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 
811 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32976  predicted protein  30.99 
 
 
324 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.682514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.21 
 
 
517 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25 
 
 
231 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  27.27 
 
 
367 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  36.76 
 
 
410 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.94 
 
 
685 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.29 
 
 
961 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
976 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.78 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  32.88 
 
 
357 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.96 
 
 
211 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  24.53 
 
 
393 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.29 
 
 
789 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4267  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.55 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0418148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  35.48 
 
 
362 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  35.48 
 
 
362 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.81 
 
 
720 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  26.81 
 
 
720 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  32.81 
 
 
647 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  32.05 
 
 
399 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  26.81 
 
 
720 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
705 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  27.84 
 
 
246 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>