27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32976 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32976  predicted protein  100 
 
 
324 aa  672    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.682514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.67 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 
487 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.92 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  24.63 
 
 
684 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08765  activator of chitin synthase (Eurofung)  27.36 
 
 
807 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.061785  normal  0.272195 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  26.88 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  24.69 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03420  enzyme activator, putative  25.17 
 
 
754 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  25.52 
 
 
789 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  25.11 
 
 
679 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 
798 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  21.99 
 
 
557 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  44.68 
 
 
1032 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.28 
 
 
961 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  33.67 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  25.13 
 
 
490 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  26.71 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  24.39 
 
 
209 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4291  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.71 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.14 
 
 
416 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
239 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 
186 aa  43.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.11 
 
 
680 aa  42.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  23.23 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  24.6 
 
 
490 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>