50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2038 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2038  molybdopterin biosynthesis protein  100 
 
 		 136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.244571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2156  serine protease  65.94 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.178592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.46 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  35.24 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  34.15 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  28.99 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29 
 
 		 487 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  27.21 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  34.43 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1032 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  34.43 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.77 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0126  putative cytochrome c-type haem-binding periplasmic protein  30.91 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.960436  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.68 
 
 		 267 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  32.26 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  34.78 
 
 		 273 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.88 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  34.31 
 
 		 234 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.54 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.16 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  24.53 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1002 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1720  Sel1 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.98 
 
 		 831 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  24.73 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  28 
 
 		 319 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.38 
 
 		 482 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.41 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 789 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.3 
 
 		 731 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0108  hypothetical protein  36.62 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.18 
 
 		 318 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.49 
 
 		 231 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.35 
 
 		 256 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0075  putative highly acidic protein  28.21 
 
 		 177 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000264098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  29.27 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.21 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.65 
 
 		 376 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  32.67 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.63 
 
 		 376 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  27.47 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0946  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.07 
 
 		 339 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.73 
 
 		 961 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>