43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0126 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0126  putative cytochrome c-type haem-binding periplasmic protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.960436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  33.59 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  26.29 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  31.33 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.46 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  26.88 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  27.1 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  35.34 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  26.25 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  28.26 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.15 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  31.9 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.23 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  31.9 
 
 		 368 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  34.45 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.62 
 
 		 367 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.8 
 
 		 273 aa  52.4  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  26.22 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 363 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.65 
 
 		 231 aa  51.2  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2038  molybdopterin biosynthesis protein  30.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.244571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  30.48 
 
 		 368 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  34.88 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0946  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.19 
 
 		 339 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.46 
 
 		 684 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.84 
 
 		 890 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2156  serine protease  31.68 
 
 		 134 aa  45.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.178592  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1402 aa  44.3  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  26.85 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  25 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.81 
 
 		 961 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  22.91 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  27.05 
 
 		 557 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.12 
 
 		 318 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  28.48 
 
 		 227 aa  42  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.07 
 
 		 305 aa  41.2  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4273  Sel1 domain-containing protein  25.15 
 
 		 284 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.194046  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4267  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.1 
 
 		 373 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0418148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.82 
 
 		 358 aa  41.2  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.59 
 
 		 278 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4244  Sel1 domain protein repeat-containing protein  21.55 
 
 		 373 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>