133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1747 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1747  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0976  Sel1 domain-containing protein  28.7 
 
 
269 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0528  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 
274 aa  99  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3249  Sel1 domain-containing protein  36.23 
 
 
289 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4035  Sel1 domain-containing protein  40.35 
 
 
277 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0527  Sel1 domain-containing protein  28.71 
 
 
284 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0529  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
275 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  27.8 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.62 
 
 
831 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.29 
 
 
684 aa  67  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.06 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  28.49 
 
 
348 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.19 
 
 
342 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.07 
 
 
961 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
890 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4453  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.36 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.09 
 
 
528 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.48 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.94 
 
 
341 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.28 
 
 
2413 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.48 
 
 
393 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.26 
 
 
172 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.71 
 
 
489 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.55 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.66 
 
 
1037 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.33 
 
 
416 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.9 
 
 
1402 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 
448 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
557 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.65 
 
 
789 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.28 
 
 
838 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.06 
 
 
685 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
1032 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.45 
 
 
185 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 
380 aa  55.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.71 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  24.83 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.41 
 
 
1493 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.87 
 
 
523 aa  52  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.46 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  25.95 
 
 
425 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
976 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.9 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  28.42 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 
132 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.16 
 
 
329 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.2 
 
 
490 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  30.63 
 
 
850 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.2 
 
 
490 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  28.21 
 
 
591 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  28 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  27.97 
 
 
256 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.66 
 
 
1002 aa  48.9  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28 
 
 
318 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  33.66 
 
 
274 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.26 
 
 
347 aa  48.5  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  26.43 
 
 
303 aa  48.5  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.35 
 
 
865 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  28.71 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.3 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
705 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.06 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.44 
 
 
248 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.73 
 
 
680 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  26.04 
 
 
478 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.2 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.44 
 
 
248 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  29.2 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.7 
 
 
693 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  30.93 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 
384 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  34.12 
 
 
1078 aa  46.2  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  34.12 
 
 
1044 aa  46.2  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.7 
 
 
376 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.7 
 
 
376 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  29.59 
 
 
117 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.52 
 
 
1877 aa  45.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  25.74 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.53 
 
 
565 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35 
 
 
552 aa  45.1  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.83 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  26.98 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  26 
 
 
342 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.32 
 
 
509 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  26.32 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.07 
 
 
731 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.32 
 
 
509 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.35 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  26.26 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.32 
 
 
509 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
664 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.32 
 
 
509 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  26.26 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0476  putative periplasmic protein  29.6 
 
 
503 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>