More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0250 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0250  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00025154  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.47 
 
 
183 aa  226  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.331928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.82 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.6 
 
 
961 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.37 
 
 
838 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.24 
 
 
684 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.59 
 
 
1402 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 
831 aa  75.5  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.59 
 
 
789 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.64 
 
 
2413 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.58 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
1430 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.91 
 
 
373 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.91 
 
 
373 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.5 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  33.09 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.45 
 
 
1877 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.01 
 
 
1037 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.6 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.54 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.59 
 
 
490 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.54 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.85 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.48 
 
 
731 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.59 
 
 
490 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.01 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00302  cell cycle inhibitor Nif1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02760)  40.7 
 
 
734 aa  67.8  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.674644 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  31.63 
 
 
1796 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  28.86 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35 
 
 
1493 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.09 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.23 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.65 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  42.35 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.46 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
763 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.39 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  33.59 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  31.68 
 
 
850 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  27.33 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 
1002 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.5 
 
 
393 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.33 
 
 
271 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.37 
 
 
305 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  39.36 
 
 
303 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.58 
 
 
464 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.78 
 
 
278 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 
341 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.6 
 
 
254 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
1032 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  35.48 
 
 
765 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.78 
 
 
523 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.04 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.6 
 
 
325 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.6 
 
 
325 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  32.84 
 
 
1200 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  32.84 
 
 
1200 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.21 
 
 
1261 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.45 
 
 
512 aa  62.4  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  33.91 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.65 
 
 
720 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.65 
 
 
720 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.65 
 
 
720 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  33.33 
 
 
1141 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  30.82 
 
 
274 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  30 
 
 
679 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  33.64 
 
 
328 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 
685 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 
890 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.9 
 
 
557 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  34.86 
 
 
971 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  31.35 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 
1910 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.84 
 
 
1263 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.33 
 
 
399 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  32.26 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.67 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 
680 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 
528 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.26 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.26 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  33.04 
 
 
327 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
679 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.11 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.93 
 
 
697 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.94 
 
 
971 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.31 
 
 
505 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.19 
 
 
1196 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.03 
 
 
1260 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.26 
 
 
331 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 
316 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>