211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4251 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
899 aa  1755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  41.08 
 
 
829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  36.92 
 
 
859 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  36.85 
 
 
897 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.4 
 
 
900 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  37.37 
 
 
992 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  35.11 
 
 
934 aa  342  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.05 
 
 
1000 aa  313  7.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
911 aa  300  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.31 
 
 
1324 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  32.21 
 
 
1500 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  32.18 
 
 
845 aa  294  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  31.41 
 
 
1309 aa  293  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.27 
 
 
843 aa  279  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
785 aa  278  4e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  30.82 
 
 
1314 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  30.41 
 
 
838 aa  269  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  30.5 
 
 
963 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.56 
 
 
1056 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  30.64 
 
 
1383 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.92 
 
 
849 aa  238  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  35.46 
 
 
675 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.83 
 
 
1523 aa  224  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  27.64 
 
 
1311 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.01 
 
 
1105 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.97 
 
 
1039 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
1262 aa  201  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.73 
 
 
793 aa  187  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.84 
 
 
713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
1050 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  27.37 
 
 
1509 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 
1128 aa  178  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.04 
 
 
1424 aa  177  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
1185 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.69 
 
 
1010 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.03 
 
 
1146 aa  173  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 
1288 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.53 
 
 
828 aa  171  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  29.41 
 
 
1261 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  33.17 
 
 
686 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  33.86 
 
 
385 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.26 
 
 
1131 aa  168  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  29.49 
 
 
801 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 
953 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.46 
 
 
1326 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
857 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 
1125 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.24 
 
 
1068 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
1088 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
776 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  35.08 
 
 
373 aa  142  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 
767 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
1283 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
1136 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
1186 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  35.6 
 
 
837 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  31.94 
 
 
1488 aa  128  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.55 
 
 
1228 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
966 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 
924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.14 
 
 
1404 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  27.71 
 
 
1468 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
640 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
284 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
843 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.04 
 
 
1475 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
454 aa  107  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
1215 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.47 
 
 
977 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.12 
 
 
672 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
568 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.01 
 
 
841 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 
568 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  42.36 
 
 
157 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.67 
 
 
1328 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  34.11 
 
 
392 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  43.55 
 
 
374 aa  97.8  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
652 aa  97.8  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.36 
 
 
2145 aa  96.3  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  30.16 
 
 
847 aa  96.3  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  33.73 
 
 
235 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
850 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 
885 aa  95.1  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 
577 aa  94.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.7 
 
 
1212 aa  94  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  40.21 
 
 
234 aa  93.6  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
671 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
751 aa  92  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.1 
 
 
822 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  41.21 
 
 
358 aa  89.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  35.89 
 
 
304 aa  89  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.24 
 
 
825 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  33.47 
 
 
702 aa  87.8  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  27.08 
 
 
965 aa  87.8  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  30.71 
 
 
1355 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  40.32 
 
 
540 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  29.67 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  34.48 
 
 
237 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  29.9 
 
 
1017 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  40.98 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>