66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0706 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  61.35 
 
 		 859 aa  211  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  54.72 
 
 		 900 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  58.54 
 
 		 1000 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  56.04 
 
 		 897 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  59.9 
 
 		 992 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  48.44 
 
 		 829 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  48.73 
 
 		 358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  45.81 
 
 		 675 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  40.21 
 
 		 899 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1209  hypothetical protein  60.49 
 
 		 110 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  38.51 
 
 		 1068 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  38.31 
 
 		 1500 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 1050 aa  76.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  39.72 
 
 		 849 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.22 
 
 		 1056 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.22 
 
 		 1424 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1383 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  35.68 
 
 		 845 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  32.62 
 
 		 1309 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 1288 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.2 
 
 		 1324 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  34.07 
 
 		 843 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  31.18 
 
 		 838 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  32.97 
 
 		 1509 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  39.01 
 
 		 1326 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 		 577 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  29.71 
 
 		 1488 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 		 1128 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  35.06 
 
 		 801 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 1262 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.14 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  35.4 
 
 		 702 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.13 
 
 		 1131 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1523 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 837 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.89 
 
 		 1314 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 814 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 1186 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.19 
 
 		 1311 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  37.76 
 
 		 686 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  30.15 
 
 		 1468 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.74 
 
 		 713 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.65 
 
 		 963 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.53 
 
 		 911 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1039 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 568 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 568 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 469 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 924 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 1105 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 		 828 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 		 1146 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 843 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  24.26 
 
 		 664 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00971  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79028]  32 
 
 		 124 aa  45.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.298424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1088 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.26 
 
 		 825 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 1125 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1010 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 767 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  32.67 
 
 		 934 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 454 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 1290 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1283 aa  41.6  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>