246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1167 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  77.39 
 
 		 1000 aa  1000    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 992 aa  1919    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  72.91 
 
 		 900 aa  1171    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  72.85 
 
 		 897 aa  1162    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  74.94 
 
 		 859 aa  1136    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  41.65 
 
 		 934 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  41.85 
 
 		 829 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.21 
 
 		 1309 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  37.29 
 
 		 845 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  47.39 
 
 		 675 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.47 
 
 		 1068 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  36.3 
 
 		 1500 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  34.81 
 
 		 838 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1383 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  38.31 
 
 		 899 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  35.71 
 
 		 843 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.34 
 
 		 1324 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  35.85 
 
 		 849 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 911 aa  376  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 785 aa  359  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  33.37 
 
 		 1056 aa  349  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.63 
 
 		 1314 aa  340  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.39 
 
 		 963 aa  333  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1523 aa  327  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  33.17 
 
 		 1509 aa  301  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  31.78 
 
 		 1311 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  35.47 
 
 		 686 aa  228  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 1050 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  32.59 
 
 		 1326 aa  218  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1039 aa  218  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 1424 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  40.28 
 
 		 385 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  33.19 
 
 		 713 aa  212  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1010 aa  206  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1088 aa  202  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 1128 aa  201  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  58.02 
 
 		 234 aa  197  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.82 
 
 		 801 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  30.18 
 
 		 793 aa  188  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 1262 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 1288 aa  185  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.19 
 
 		 1261 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 1125 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1283 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1105 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 1185 aa  175  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  43.31 
 
 		 373 aa  174  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 924 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 857 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.83 
 
 		 828 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  35.51 
 
 		 457 aa  151  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 1146 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.78 
 
 		 1131 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 1136 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 953 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  27.31 
 
 		 1468 aa  138  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.5 
 
 		 1488 aa  135  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 837 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  51.52 
 
 		 358 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 814 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 850 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 577 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 966 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 640 aa  121  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 767 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1209  hypothetical protein  59.79 
 
 		 110 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.62 
 
 		 1228 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 		 1186 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1404 aa  108  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  41.33 
 
 		 266 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1212 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 843 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  43.26 
 
 		 405 aa  97.8  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 776 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  34.32 
 
 		 715 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 671 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 652 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  37.5 
 
 		 157 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.69 
 
 		 841 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  31.16 
 
 		 392 aa  92  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  32.16 
 
 		 1355 aa  91.3  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  34.4 
 
 		 388 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  38.66 
 
 		 374 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 540 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  28.82 
 
 		 847 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  34.15 
 
 		 238 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  41.84 
 
 		 161 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.18 
 
 		 1328 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  35.76 
 
 		 237 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26.15 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1215 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  32.09 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  36.67 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.55 
 
 		 1901 aa  81.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  39.77 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 915 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  33.49 
 
 		 958 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>