219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1862 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  70.04 
 
 		 859 aa  1113    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  70.55 
 
 		 1000 aa  930    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 897 aa  1736    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  74.06 
 
 		 992 aa  1093    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  72.86 
 
 		 900 aa  1173    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  42.21 
 
 		 934 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  41.43 
 
 		 829 aa  473  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  45.48 
 
 		 675 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  34.73 
 
 		 1309 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  37.18 
 
 		 899 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.07 
 
 		 1324 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  36 
 
 		 845 aa  386  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 911 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  35.13 
 
 		 1500 aa  373  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  33.54 
 
 		 838 aa  357  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  35.74 
 
 		 843 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1383 aa  354  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 785 aa  350  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1068 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.76 
 
 		 963 aa  341  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  34.83 
 
 		 849 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  32.66 
 
 		 1314 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.24 
 
 		 1056 aa  325  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31.26 
 
 		 1523 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  32.65 
 
 		 1509 aa  282  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  32.88 
 
 		 1311 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  32.11 
 
 		 1326 aa  224  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  40.06 
 
 		 385 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1039 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  34.25 
 
 		 686 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1088 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.32 
 
 		 801 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.71 
 
 		 713 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1010 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.28 
 
 		 1424 aa  195  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 1050 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  56.04 
 
 		 234 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  42.77 
 
 		 373 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 1288 aa  170  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 1128 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  29.16 
 
 		 793 aa  168  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.85 
 
 		 1261 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 		 828 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 857 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1283 aa  162  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.1 
 
 		 1131 aa  161  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 1125 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 		 1146 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 1262 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  36.15 
 
 		 457 aa  155  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 924 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1105 aa  150  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 		 1185 aa  149  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 953 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 850 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 814 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 1468 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  47.34 
 
 		 358 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 966 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 640 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 1136 aa  111  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  27.43 
 
 		 1488 aa  110  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 837 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1212 aa  106  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 843 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1404 aa  104  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 751 aa  101  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.42 
 
 		 841 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1209  hypothetical protein  70 
 
 		 110 aa  99.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  31.54 
 
 		 715 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 671 aa  98.6  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 		 652 aa  98.6  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  29.76 
 
 		 847 aa  97.8  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  43.26 
 
 		 405 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  36.71 
 
 		 266 aa  94.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  38.04 
 
 		 237 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  35.37 
 
 		 235 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.04 
 
 		 1228 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  38.58 
 
 		 1355 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 454 aa  92.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  37.95 
 
 		 238 aa  92  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 776 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  36.3 
 
 		 157 aa  91.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  37.33 
 
 		 374 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 1186 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  30.88 
 
 		 392 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  37.4 
 
 		 540 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  32.52 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  27.16 
 
 		 958 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.01 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  35.88 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  30.77 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  42.25 
 
 		 564 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.91 
 
 		 1475 aa  78.2  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 526 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  25.4 
 
 		 965 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>