41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8809 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  91.6 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  48.28 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  42.02 
 
 		 911 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  41.49 
 
 		 785 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  45.65 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  44.83 
 
 		 157 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  49.69 
 
 		 385 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  50 
 
 		 161 aa  121  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  46.95 
 
 		 405 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  44.91 
 
 		 934 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  49.3 
 
 		 564 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  41.98 
 
 		 358 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  39.33 
 
 		 374 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  41.42 
 
 		 705 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  44.62 
 
 		 540 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  33.33 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  41.67 
 
 		 1901 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  43.97 
 
 		 1056 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  42.77 
 
 		 715 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  38.73 
 
 		 1355 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 850 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  38.16 
 
 		 464 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  37.42 
 
 		 829 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35 
 
 		 859 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  33.14 
 
 		 899 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1068 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  32.75 
 
 		 793 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  33.53 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  35.54 
 
 		 897 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  40.18 
 
 		 963 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.54 
 
 		 900 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  35 
 
 		 992 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  26.26 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  33.88 
 
 		 1309 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1526 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  40.74 
 
 		 373 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  26.92 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 1807 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  27.48 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  25.23 
 
 		 367 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>