82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1875 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  100 
 
 		 564 aa  1139    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2996  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  41.94 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958202  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  58.66 
 
 		 934 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  55.25 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  63.89 
 
 		 161 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  55.22 
 
 		 1355 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0361  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  34.19 
 
 		 387 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  45.29 
 
 		 235 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  39.13 
 
 		 715 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  46.56 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  47.26 
 
 		 911 aa  137  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6446  hypothetical protein  31.81 
 
 		 395 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0878976  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  41.8 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  46.71 
 
 		 237 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 785 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  38.79 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  49.3 
 
 		 238 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  49.32 
 
 		 850 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  52.82 
 
 		 1056 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  40.21 
 
 		 374 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  40.83 
 
 		 266 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  45.28 
 
 		 705 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  43.33 
 
 		 1901 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  41.29 
 
 		 157 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  39.71 
 
 		 388 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  46.53 
 
 		 829 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  40.16 
 
 		 268 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  37.2 
 
 		 859 aa  90.1  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  35.14 
 
 		 899 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  35.15 
 
 		 524 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  38.1 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  37.36 
 
 		 900 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  42.25 
 
 		 897 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1068 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  41.38 
 
 		 992 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  37.22 
 
 		 963 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  29.44 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  44.79 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.6 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4512  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.21 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.89 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  33.12 
 
 		 1309 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.19 
 
 		 339 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.83 
 
 		 330 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.16 
 
 		 333 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  24.15 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3295  KDPG and KHG aldolase  31.45 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.808807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26 
 
 		 329 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  27.85 
 
 		 315 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1924  putative TRAP transporter solute receptor  33.9 
 
 		 350 aa  54.7  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00617183  hitchhiker  0.0000000000275167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  26.26 
 
 		 313 aa  54.3  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  32.06 
 
 		 793 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.18 
 
 		 325 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.99 
 
 		 350 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.76 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.91 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2149  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.38 
 
 		 295 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0737588  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.45 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1526 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0585  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.43 
 
 		 341 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  30.65 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.8 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.29 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2520  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.83 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.32 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.6 
 
 		 323 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5695  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.17 
 
 		 308 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0713  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.94 
 
 		 342 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.93 
 
 		 329 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1010 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.94 
 
 		 337 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.45 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.38 
 
 		 317 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1445  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.25 
 
 		 307 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.08 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.74 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.14 
 
 		 318 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  26.13 
 
 		 316 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  29.09 
 
 		 570 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.14 
 
 		 332 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3359  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.96 
 
 		 366 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  hitchhiker  0.000000000800909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.56 
 
 		 333 aa  43.5  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>