44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6446 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6446  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0878976  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0361  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  60.91 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  32.24 
 
 		 564 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2996  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.99 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958202  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.31 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.06 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1445  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.31 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0713  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.33 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0585  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.9 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  25.71 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.17 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4597  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.59 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.244351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.35 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4512  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.79 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.9 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.67 
 
 		 329 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5695  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.69 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  26.03 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3359  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.26 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  hitchhiker  0.000000000800909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1781  hypothetical protein  28.26 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1635  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.11 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0033  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.71 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.08 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.19 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.35 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3793  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.18 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.848653  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.6 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.42 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.31 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.43 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.18 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4331  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.88 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  25.71 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  27.15 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.73 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0380  periplasmic-binding protein  21.94 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000526249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  23.59 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  23.23 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.23 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  22.67 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.49 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  25.18 
 
 		 451 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.68 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1256  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.12 
 
 		 344 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>