38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6357 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  100 
 
 		 715 aa  1398    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  48.35 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  48.56 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  43.14 
 
 		 934 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  53.02 
 
 		 850 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  46.91 
 
 		 358 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  47.31 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  47.2 
 
 		 705 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  44.91 
 
 		 266 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  49.66 
 
 		 1355 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  48.32 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  49.33 
 
 		 1056 aa  126  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  46.05 
 
 		 235 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 911 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  48.26 
 
 		 564 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  41.42 
 
 		 1901 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  46.77 
 
 		 374 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  42.77 
 
 		 238 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  43.67 
 
 		 237 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.33 
 
 		 859 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  39.84 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.83 
 
 		 829 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  41.67 
 
 		 157 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  38.18 
 
 		 524 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  39.47 
 
 		 464 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  50 
 
 		 963 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  31.18 
 
 		 897 aa  87.8  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  42.95 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  30.91 
 
 		 900 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 		 899 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1068 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  39.47 
 
 		 992 aa  70.5  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 1119 aa  61.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 		 994 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  32.61 
 
 		 793 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  34.65 
 
 		 1309 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>