72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7217 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 994 aa  1954    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  34.37 
 
 		 1119 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 578 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 702 aa  128  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 639 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 649 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 		 1147 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  28.77 
 
 		 665 aa  108  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  41.8 
 
 		 310 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 1437 aa  93.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.76 
 
 		 732 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  27.33 
 
 		 762 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.84 
 
 		 1507 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 1186 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.47 
 
 		 767 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1285 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  37.2 
 
 		 830 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.22 
 
 		 1611 aa  75.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.43 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 878 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.71 
 
 		 2145 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4905  Tetratricopeptide TPR_4  32.13 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  39.52 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1123 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1550 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 		 997 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1105 aa  65.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.45 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 843 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.35 
 
 		 1328 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1215 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.75 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 771 aa  57.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 1476 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 		 991 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 568 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 1087 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 568 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 924 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 953 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0657  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 811 aa  55.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  29.3 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 1363 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 927 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 814 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1404 aa  52.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1082 aa  51.6  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1028 aa  51.2  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.88 
 
 		 1266 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 444 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 911 aa  49.7  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.72 
 
 		 493 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.31 
 
 		 689 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 718 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25.54 
 
 		 799 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 284 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.42 
 
 		 852 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.45 
 
 		 2413 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.47 
 
 		 632 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 481 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 635 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 635 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 612 aa  45.8  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1142 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1276 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 243 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.9 
 
 		 714 aa  45.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 454 aa  45.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1101 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 611 aa  44.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>