63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1114 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1147 aa  2304    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1119 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 578 aa  144  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1437 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 702 aa  107  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  28.13 
 
 		 994 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 639 aa  98.6  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 649 aa  89.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.59 
 
 		 2145 aa  82.4  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 		 1507 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 1186 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.06 
 
 		 767 aa  75.5  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  32.37 
 
 		 310 aa  73.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.82 
 
 		 1328 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  23.42 
 
 		 762 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.27 
 
 		 725 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.98 
 
 		 672 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1105 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 665 aa  67.8  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1215 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 843 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  34.82 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.34 
 
 		 732 aa  64.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 878 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.96 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 924 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 885 aa  56.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 481 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 444 aa  54.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  19.02 
 
 		 1550 aa  54.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 568 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 568 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.33 
 
 		 1228 aa  52  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  23.6 
 
 		 1087 aa  51.6  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.09 
 
 		 957 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  21.97 
 
 		 740 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 751 aa  51.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 3035 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1116 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 162 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 911 aa  49.7  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  23.73 
 
 		 2413 aa  49.7  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.27 
 
 		 771 aa  49.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  21.43 
 
 		 493 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 284 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 247 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 		 3560 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1082 aa  47.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1404 aa  46.6  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 596 aa  46.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  32.46 
 
 		 830 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 3172 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 361 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.58 
 
 		 680 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 454 aa  45.8  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 162 aa  45.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1123 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 577 aa  45.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 4489 aa  45.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  31.07 
 
 		 807 aa  44.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1039 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>