14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1079 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 830 aa  1561    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1119 aa  97.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  31.84 
 
 		 994 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  34.36 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 702 aa  74.3  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  28.63 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  30.22 
 
 		 404 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1437 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 455 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  28 
 
 		 762 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1147 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>