111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0657 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0657  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 811 aa  1631    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  36.96 
 
 		 932 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.08 
 
 		 1694 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 793 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1276 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 543 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 602 aa  111  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 813 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6891  hypothetical protein  25.39 
 
 		 972 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 955 aa  100  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 4079 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 4489 aa  95.5  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 927 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.33 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.67 
 
 		 1007 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 711 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1094 aa  81.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1138 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 935 aa  79  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.98 
 
 		 1979 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.53 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1123 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1192 aa  71.6  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.11 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 740 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 523 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 761 aa  68.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1276 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.38 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 878 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 836 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  23.51 
 
 		 623 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 3035 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1119 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3560 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 608 aa  60.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.3 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.43 
 
 		 292 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1069 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.1 
 
 		 707 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 202 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.53 
 
 		 397 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  25.46 
 
 		 897 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 213 aa  54.7  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  26.73 
 
 		 994 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.66 
 
 		 730 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  26.37 
 
 		 725 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  27.05 
 
 		 724 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 296 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  24.71 
 
 		 714 aa  52  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 		 341 aa  51.2  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 416 aa  50.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 221 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 250 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  22.1 
 
 		 791 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 452 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 279 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 684 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1827 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.42 
 
 		 576 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  25.97 
 
 		 615 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 377 aa  48.9  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 388 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 		 1266 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 361 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0438  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 164 aa  48.1  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000401129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 685 aa  47.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.19 
 
 		 1013 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 716 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1054 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 414 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  24.73 
 
 		 743 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  23.01 
 
 		 955 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0351  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 553 aa  46.6  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 578 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 388 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 875 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.68 
 
 		 622 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 702 aa  46.2  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 994 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.13 
 
 		 560 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 393 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1862  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>