32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1875 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 813 aa  1663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 793 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  33.08 
 
 		 932 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 922 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 965 aa  124  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  28.86 
 
 		 673 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  28.61 
 
 		 581 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0657  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 811 aa  105  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  23.87 
 
 		 756 aa  97.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  24.07 
 
 		 692 aa  86.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4861  hypothetical protein  23.5 
 
 		 920 aa  67.8  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  22.16 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1276 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.07 
 
 		 1694 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 927 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 4489 aa  51.6  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 329 aa  51.6  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 363 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25 
 
 		 1138 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 4079 aa  47.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 562 aa  47.8  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  20.22 
 
 		 369 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 244 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.81 
 
 		 1979 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 3560 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 543 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0309  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 116 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143166  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 955 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 471 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.28 
 
 		 417 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 596 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 711 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>