33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2442 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  100 
 
 		 756 aa  1559    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  46.85 
 
 		 692 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 965 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 922 aa  238  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  34.3 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  32.14 
 
 		 673 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 523 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  27.35 
 
 		 932 aa  124  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 793 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 813 aa  84  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  21 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4861  hypothetical protein  20.7 
 
 		 920 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.58 
 
 		 265 aa  54.3  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  26.13 
 
 		 397 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.58 
 
 		 684 aa  52.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 298 aa  51.2  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  30.57 
 
 		 850 aa  50.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1877 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1402 aa  49.7  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 255 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.52 
 
 		 838 aa  48.5  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0250  Sel1 repeat-containing protein  29.32 
 
 		 191 aa  47.8  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00025154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.06 
 
 		 298 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.81 
 
 		 789 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.08 
 
 		 232 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 534 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 181 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  29.59 
 
 		 985 aa  45.8  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.31 
 
 		 961 aa  46.2  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 330 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.16 
 
 		 185 aa  45.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>