227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1130 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  100 
 
 
665 aa  1339    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  45.75 
 
 
649 aa  229  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  40.23 
 
 
639 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
1119 aa  160  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
1285 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  32.61 
 
 
732 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
578 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  32.12 
 
 
1123 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
702 aa  127  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.01 
 
 
767 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
454 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.53 
 
 
1424 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 
843 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.8 
 
 
782 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.56 
 
 
568 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
568 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.61 
 
 
1328 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
1215 aa  107  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
725 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 
1186 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  28.77 
 
 
994 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 
672 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.67 
 
 
2145 aa  103  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
1060 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  32.44 
 
 
310 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  33.23 
 
 
825 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
1437 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.13 
 
 
828 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.19 
 
 
1550 aa  101  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.96 
 
 
493 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 
1288 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.71 
 
 
1404 aa  99.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.53 
 
 
1279 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.78 
 
 
694 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
911 aa  95.9  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
444 aa  95.5  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.48 
 
 
991 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.79 
 
 
1131 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
857 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
1363 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 
1266 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 
885 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  25.74 
 
 
807 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
1105 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 
787 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 
1507 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.11 
 
 
1238 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
751 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.03 
 
 
1611 aa  84.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  24.38 
 
 
941 aa  84.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
636 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
771 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
1082 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
343 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  27.13 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
1313 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 
957 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.6 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  41.13 
 
 
404 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
1025 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  32.12 
 
 
1581 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
953 aa  77.8  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  27 
 
 
340 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.85 
 
 
740 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
924 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.85 
 
 
1228 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 
991 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
1054 aa  73.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
412 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.91 
 
 
311 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  28.05 
 
 
680 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.33 
 
 
708 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
809 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.46 
 
 
854 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
1101 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3100  hypothetical protein  29.08 
 
 
1098 aa  72  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.143257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 
985 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1147 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  24.26 
 
 
1068 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  22.51 
 
 
1087 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.7 
 
 
2327 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
1596 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.01 
 
 
1044 aa  67.4  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
785 aa  67.4  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
878 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.52 
 
 
1212 aa  67  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
443 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
3145 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25 
 
 
1106 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
1028 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
966 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.03 
 
 
977 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.94 
 
 
809 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
1195 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
1526 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.71 
 
 
1009 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  27.36 
 
 
686 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
937 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>