100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1127 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  827    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  48.39 
 
 
1119 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
702 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 
578 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  37.36 
 
 
310 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  41.73 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
649 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
843 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  39.52 
 
 
994 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
878 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  41.13 
 
 
665 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.08 
 
 
732 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  33.93 
 
 
1550 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  38.89 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.04 
 
 
2145 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.93 
 
 
1186 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 
1363 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.44 
 
 
991 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
1147 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
1476 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  38.79 
 
 
997 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.51 
 
 
1404 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  30.6 
 
 
1123 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.96 
 
 
767 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.91 
 
 
810 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
568 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 
568 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  30.22 
 
 
830 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
1285 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
481 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1215 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1437 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  34.88 
 
 
725 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
685 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.67 
 
 
725 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.75 
 
 
493 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  34.21 
 
 
1328 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  36.44 
 
 
1507 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.13 
 
 
828 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.46 
 
 
825 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
1621 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 
885 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
3145 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  34.43 
 
 
762 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.63 
 
 
2413 aa  51.2  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.41 
 
 
1212 aa  51.2  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
1519 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  38.46 
 
 
1219 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.91 
 
 
1228 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  32 
 
 
680 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.3 
 
 
622 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  33.33 
 
 
1131 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  32.31 
 
 
724 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 
1114 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.43 
 
 
764 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  30.63 
 
 
897 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.4 
 
 
1694 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.85 
 
 
1288 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
637 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
1054 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
632 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  27.34 
 
 
1581 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.35 
 
 
1009 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 
573 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
1448 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
1060 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  28.3 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  36.79 
 
 
919 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
1779 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  34.21 
 
 
1141 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
681 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
3172 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.56 
 
 
799 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  23.03 
 
 
1106 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
750 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
1711 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
591 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.43 
 
 
875 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.48 
 
 
708 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.37 
 
 
1039 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 
572 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
612 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.01 
 
 
725 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.34 
 
 
865 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
1486 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  25.89 
 
 
550 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  31.45 
 
 
1104 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.86 
 
 
587 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
217 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
605 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
1911 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
374 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
1105 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>