49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6887 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  36.12 
 
 		 464 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 911 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 850 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  39.16 
 
 		 785 aa  97.8  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  37.72 
 
 		 715 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 		 358 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  38.93 
 
 		 1355 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  37.67 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  34.91 
 
 		 705 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  37.66 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  32.29 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  37.2 
 
 		 235 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  39.23 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  33.72 
 
 		 237 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  34.08 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  28.9 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  33.53 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.32 
 
 		 1901 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  34.29 
 
 		 934 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  30.05 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  32.12 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  32.02 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  36.26 
 
 		 963 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  32.58 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  32.73 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  29.56 
 
 		 308 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  32.97 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  35.16 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  29.58 
 
 		 856 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  35.33 
 
 		 1056 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  31.52 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  31.54 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  32.33 
 
 		 161 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  35.82 
 
 		 258 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  32.62 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  31.3 
 
 		 859 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  31.62 
 
 		 751 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1068 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  41.18 
 
 		 241 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  27.48 
 
 		 897 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  37.88 
 
 		 992 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 		 829 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  34.85 
 
 		 900 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.41 
 
 		 793 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  27.08 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>