65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1486 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1363    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2629  hypothetical protein  39.1 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  53.01 
 
 		 358 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  58.39 
 
 		 540 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  45.57 
 
 		 266 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  49.7 
 
 		 385 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  50.67 
 
 		 850 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  47.2 
 
 		 715 aa  134  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  41.58 
 
 		 374 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 911 aa  128  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 785 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  41.67 
 
 		 235 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  44.94 
 
 		 934 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  41.45 
 
 		 1901 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  41.86 
 
 		 405 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  44.72 
 
 		 1355 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  45.28 
 
 		 564 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  45.07 
 
 		 161 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  41.42 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  41.42 
 
 		 237 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  42.66 
 
 		 1056 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  37.59 
 
 		 388 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  52.59 
 
 		 963 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  39.86 
 
 		 157 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  34.97 
 
 		 268 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  41.06 
 
 		 464 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  35.19 
 
 		 524 aa  87.8  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  39.68 
 
 		 829 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  34.5 
 
 		 899 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  39.09 
 
 		 859 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  37.41 
 
 		 1068 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5112  hypothetical protein  41.67 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  38.38 
 
 		 1309 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  37.27 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  37.27 
 
 		 992 aa  69.7  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.45 
 
 		 900 aa  67.4  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  31.74 
 
 		 793 aa  63.9  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  31.2 
 
 		 327 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1526 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1522  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.13 
 
 		 367 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 1146 aa  54.3  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  46.88 
 
 		 259 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2808  hypothetical protein  40.85 
 
 		 141 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.446189  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 1807 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  38.03 
 
 		 124 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  39.09 
 
 		 373 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0546  hypothetical protein  41.33 
 
 		 123 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  0.680217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  29.85 
 
 		 570 aa  50.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  38.36 
 
 		 122 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3620  protein of unknown function DUF559  36.17 
 
 		 142 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2534  hypothetical protein  34.55 
 
 		 114 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.984532  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5447  protein of unknown function DUF559  38.46 
 
 		 137 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  40.62 
 
 		 142 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  37.27 
 
 		 270 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  28.35 
 
 		 2914 aa  48.5  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  37.66 
 
 		 330 aa  48.5  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  39.44 
 
 		 137 aa  48.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  38.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  38.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  37.97 
 
 		 123 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1774  hypothetical protein  37.14 
 
 		 146 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  39.73 
 
 		 123 aa  45.8  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51690  hypothetical protein  39.44 
 
 		 120 aa  44.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00189742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>