42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3107 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  48.85 
 
 
237 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  48.28 
 
 
238 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  52.76 
 
 
388 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  52.48 
 
 
911 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 
785 aa  148  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  42.05 
 
 
1901 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  43.39 
 
 
266 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  48.95 
 
 
374 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  52.34 
 
 
540 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  46.43 
 
 
358 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  48.18 
 
 
161 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  49.34 
 
 
385 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  45.99 
 
 
157 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  45.29 
 
 
564 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  40.44 
 
 
405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  46.05 
 
 
715 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  41.67 
 
 
705 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 
850 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  45.38 
 
 
1355 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  41.94 
 
 
934 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  41.55 
 
 
1056 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  33.73 
 
 
899 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  39.52 
 
 
829 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  37.28 
 
 
1068 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  39.16 
 
 
464 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  41.23 
 
 
963 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  37.2 
 
 
524 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.04 
 
 
859 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  36.05 
 
 
897 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  34.33 
 
 
793 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  34.65 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  32.45 
 
 
1309 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  37.5 
 
 
992 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  36.5 
 
 
900 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  31.08 
 
 
303 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 
1807 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  24.3 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  30.14 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  31.18 
 
 
367 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
1526 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  24.79 
 
 
1048 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>