101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4184 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  100 
 
 		 1048 aa  2174    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  56.46 
 
 		 1348 aa  797    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  54.06 
 
 		 1363 aa  765    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  48.43 
 
 		 1656 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  45.41 
 
 		 1373 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  35.78 
 
 		 782 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  34.87 
 
 		 783 aa  212  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  31.95 
 
 		 781 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.73 
 
 		 717 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.27 
 
 		 746 aa  190  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.05 
 
 		 872 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.05 
 
 		 872 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  31.74 
 
 		 643 aa  170  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  40 
 
 		 880 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  40 
 
 		 880 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  31 
 
 		 787 aa  160  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  42.21 
 
 		 825 aa  158  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.41 
 
 		 841 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.28 
 
 		 865 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  44.32 
 
 		 947 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  30.32 
 
 		 902 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  29.91 
 
 		 902 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  36.77 
 
 		 1016 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  36.77 
 
 		 1016 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.11 
 
 		 678 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  27.79 
 
 		 633 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.82 
 
 		 757 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 737 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  29.06 
 
 		 619 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  36.6 
 
 		 1279 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  36.6 
 
 		 1279 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  29.09 
 
 		 583 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  26.76 
 
 		 744 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 922 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 735 aa  112  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  31 
 
 		 544 aa  105  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 664 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 945 aa  98.2  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 		 935 aa  95.5  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  25.59 
 
 		 598 aa  91.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  23.54 
 
 		 686 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  25.31 
 
 		 696 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.8 
 
 		 137 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 702 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 367 aa  66.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  39.36 
 
 		 969 aa  65.1  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  32.14 
 
 		 291 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  30.25 
 
 		 138 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  36.36 
 
 		 796 aa  63.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.3 
 
 		 1357 aa  61.6  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  33.04 
 
 		 303 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  30.49 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.05 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 777 aa  57.4  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  31.36 
 
 		 331 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  27.54 
 
 		 251 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 		 357 aa  55.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31.25 
 
 		 286 aa  55.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1526 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  29.63 
 
 		 265 aa  53.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  27.62 
 
 		 413 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  29.07 
 
 		 441 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  28 
 
 		 570 aa  52.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  24.43 
 
 		 645 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  30.84 
 
 		 320 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 911 aa  52.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.72 
 
 		 490 aa  52.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0912  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  51.6  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251322  hitchhiker  0.0061785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4342  hypothetical protein  27.01 
 
 		 396 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4404  hypothetical protein  27.01 
 
 		 396 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  hitchhiker  0.00107284 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 785 aa  51.6  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  30.53 
 
 		 227 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  30.08 
 
 		 255 aa  50.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 		 845 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  26.85 
 
 		 431 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  50.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  26.26 
 
 		 290 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  29.35 
 
 		 250 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  30.36 
 
 		 354 aa  49.3  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 233 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  33.33 
 
 		 245 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  23.68 
 
 		 292 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  28.33 
 
 		 384 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  48.5  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  27.66 
 
 		 243 aa  48.5  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  27.59 
 
 		 859 aa  48.5  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  29.47 
 
 		 233 aa  47.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1298  ankyrin  33.33 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  29.45 
 
 		 378 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  26.15 
 
 		 388 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  29.45 
 
 		 378 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  47  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  26.53 
 
 		 374 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.33 
 
 		 1611 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  30.34 
 
 		 374 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  29.82 
 
 		 499 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  25.32 
 
 		 431 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>