35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3409 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1529    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  82.1 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2605  hypothetical protein  41.04 
 
 		 543 aa  162  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7167  hypothetical protein  46.47 
 
 		 336 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4826  hypothetical protein  42.07 
 
 		 880 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0073  hypothetical protein  45.59 
 
 		 530 aa  124  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0802  hypothetical protein  44.31 
 
 		 304 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  35.65 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1927  hypothetical protein  45.14 
 
 		 529 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.671965  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0937  hypothetical protein  32.77 
 
 		 418 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.19 
 
 		 1357 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  36.45 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.94 
 
 		 1348 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  36.47 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  42.74 
 
 		 846 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  41.33 
 
 		 880 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  41.33 
 
 		 880 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  43.14 
 
 		 835 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  42.16 
 
 		 837 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  43.14 
 
 		 834 aa  52  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  43.14 
 
 		 830 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  43.14 
 
 		 834 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  42.16 
 
 		 837 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.3 
 
 		 1363 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.82 
 
 		 1656 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  28.97 
 
 		 566 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.75 
 
 		 490 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  34.12 
 
 		 825 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  43.68 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  41.75 
 
 		 832 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1016 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1016 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  51.38 
 
 		 839 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4257  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  38 
 
 		 794 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  32.08 
 
 		 367 aa  44.3  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>