48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4288 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  100 
 
 		 138 aa  286  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 441 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.33 
 
 		 1348 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  33.64 
 
 		 598 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  32.28 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  29.82 
 
 		 331 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  33.04 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.25 
 
 		 1048 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  28.46 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.7 
 
 		 825 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.97 
 
 		 1363 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  31.71 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.6 
 
 		 1016 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.6 
 
 		 1016 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  25.81 
 
 		 290 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 357 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 		 1656 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.55 
 
 		 490 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.77 
 
 		 1373 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  26.12 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3083  TIR protein  35.37 
 
 		 824 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  32.05 
 
 		 404 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  29.21 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  35.06 
 
 		 453 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  32.43 
 
 		 796 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  27.64 
 
 		 323 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  26 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.21 
 
 		 880 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 947 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  28.45 
 
 		 431 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.21 
 
 		 880 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 877 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 		 1279 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 383 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1279 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  26.62 
 
 		 969 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  26.37 
 
 		 413 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  24.19 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  29.87 
 
 		 356 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  25.25 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  27.55 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.37 
 
 		 1611 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 		 517 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  30.85 
 
 		 299 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>