18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3566 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  34.9 
 
 		 598 aa  89  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  30.08 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  27.52 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  29.17 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  28.99 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  28.22 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.75 
 
 		 880 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.75 
 
 		 880 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  28.16 
 
 		 585 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.61 
 
 		 570 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  27.27 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  31.07 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  36.25 
 
 		 825 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  29.52 
 
 		 290 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>