29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0104 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  59.74 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  23.73 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  42.31 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  33.07 
 
 		 598 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  24.29 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  29.17 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  24.27 
 
 		 231 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  32.39 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.82 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  23.11 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  27.92 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.46 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  30.71 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2259  hypothetical protein  42.55 
 
 		 76 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  28.45 
 
 		 195 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  29.82 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.62 
 
 		 570 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.94 
 
 		 137 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  27.01 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  28.57 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  22.43 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  31.37 
 
 		 585 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.81 
 
 		 1363 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  29.7 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.81 
 
 		 825 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  29.31 
 
 		 314 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>