47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0066 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  796    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  59.74 
 
 		 386 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  35.43 
 
 		 598 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  43.59 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  23.64 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  33.63 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  34.33 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  30.08 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  28.12 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  34.31 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  28.17 
 
 		 335 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  31.31 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  24.66 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  24 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  28.33 
 
 		 1048 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2259  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  23.5 
 
 		 231 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 		 584 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  32.35 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  33.01 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  28.57 
 
 		 942 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  32.11 
 
 		 586 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  32.08 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  23.67 
 
 		 851 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  26.83 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  26 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.66 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.33 
 
 		 1363 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.69 
 
 		 825 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  39.39 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  27.59 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 		 1348 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  40.62 
 
 		 552 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  30.51 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  26.81 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.17 
 
 		 880 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.17 
 
 		 880 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.17 
 
 		 947 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.07 
 
 		 517 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  26.56 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3998  hypothetical protein  29.31 
 
 		 478 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>