26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0766 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  593  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  31.37 
 
 		 431 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  32.5 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1348 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  33.66 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  37.84 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.71 
 
 		 947 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  28 
 
 		 453 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  38.1 
 
 		 1363 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  28.57 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 1016 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 1016 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  31.13 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.91 
 
 		 1373 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  30 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.47 
 
 		 1656 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  30.53 
 
 		 598 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  27.78 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  27.36 
 
 		 851 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.6 
 
 		 880 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  29.29 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.6 
 
 		 880 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  29.52 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  24.19 
 
 		 138 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  26.26 
 
 		 163 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>