14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3047 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  54.45 
 
 
356 aa  342  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  33.71 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  33.71 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3017  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000253607  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4505  hypothetical protein  32.8 
 
 
308 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133384 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0601  hypothetical protein  24.88 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.28476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  29.21 
 
 
138 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2635  hypothetical protein  31.03 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0162237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  32.18 
 
 
385 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1272  hypothetical protein  29.89 
 
 
380 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1906  hypothetical protein  22.5 
 
 
203 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>