48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2941 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  43.97 
 
 
517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  44.85 
 
 
566 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  37.5 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  45.83 
 
 
586 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  44.04 
 
 
398 aa  109  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  43.12 
 
 
398 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  43.64 
 
 
517 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  40.16 
 
 
570 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3998  hypothetical protein  31.75 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  33.09 
 
 
413 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  31.25 
 
 
1048 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.07 
 
 
490 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  32.14 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  34.83 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  30.68 
 
 
137 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  29.82 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  28.57 
 
 
485 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.17 
 
 
1357 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
1348 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  32.46 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.34 
 
 
880 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.11 
 
 
825 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  34.78 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.34 
 
 
880 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  30.26 
 
 
320 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  31.15 
 
 
374 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  32 
 
 
325 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  31.11 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  26.83 
 
 
384 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  31.45 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  32 
 
 
942 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  31.45 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  26.47 
 
 
598 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
785 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.58 
 
 
947 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  31 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  26.79 
 
 
585 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  29.41 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  32.58 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  26.47 
 
 
796 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  31.82 
 
 
441 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  32.47 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  27.03 
 
 
552 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  35.62 
 
 
500 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
1656 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  27.84 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
911 aa  42.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>