18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2293 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  99.44 
 
 		 358 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  33.71 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  28.05 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4505  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133384 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3017  hypothetical protein  40.52 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000253607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1906  hypothetical protein  26.61 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0601  hypothetical protein  29.17 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.28476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  35.37 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31.45 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.59 
 
 		 1016 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  30.59 
 
 		 1016 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  27.1 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  35.06 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0280  hypothetical protein  24.44 
 
 		 673 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.06 
 
 		 880 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.06 
 
 		 880 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.09 
 
 		 825 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>