More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5806 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
664 aa  1334    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  40.67 
 
 
902 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  40.16 
 
 
902 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.41 
 
 
757 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  40.75 
 
 
696 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
922 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  38.73 
 
 
735 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.65 
 
 
744 aa  237  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
935 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  36.16 
 
 
583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  33.99 
 
 
737 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
945 aa  207  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.5 
 
 
717 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  33.76 
 
 
633 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
643 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  33.49 
 
 
686 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.7 
 
 
746 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  37.8 
 
 
457 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
857 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  30.81 
 
 
619 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  34.59 
 
 
453 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
873 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.5 
 
 
678 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3207  histidine kinase  35.77 
 
 
347 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00238507  normal  0.252728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  35.61 
 
 
695 aa  160  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  31.6 
 
 
782 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
680 aa  154  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  36.07 
 
 
1114 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  29.67 
 
 
872 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  29.67 
 
 
872 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2864  histidine kinase  32.42 
 
 
731 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  32.47 
 
 
739 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.03 
 
 
1780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  31.76 
 
 
787 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  31.43 
 
 
781 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  32.75 
 
 
865 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.21 
 
 
1774 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  28.67 
 
 
783 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
702 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.36 
 
 
841 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
1072 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.29 
 
 
1808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
971 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  27.76 
 
 
645 aa  111  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
440 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
455 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
439 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
919 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
1036 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
1146 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
450 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
594 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  29.55 
 
 
566 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
641 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
699 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.27 
 
 
819 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  30.21 
 
 
726 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.11 
 
 
833 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
852 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3756  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
452 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.76 
 
 
1901 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
458 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
494 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  29.93 
 
 
315 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
480 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 
819 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
459 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
928 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
848 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  29.21 
 
 
715 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  30.43 
 
 
249 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
537 aa  102  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 
850 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
449 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 
850 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  31.27 
 
 
560 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2941  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.3 
 
 
719 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
683 aa  101  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
431 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  29.71 
 
 
1850 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
844 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.27 
 
 
1780 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3068  histidine kinase  26.62 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.158411  normal  0.556433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
713 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
769 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  29.96 
 
 
458 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1180  ATP-binding region, ATPase-like  27.55 
 
 
451 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513704  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
1021 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
374 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
868 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
715 aa  98.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  28.21 
 
 
1048 aa  98.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  26.83 
 
 
1811 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1145  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
457 aa  97.4  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
633 aa  97.4  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4969  putative two-component sensor  30.3 
 
 
698 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.83 
 
 
652 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
688 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
392 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>