115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2806 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  100 
 
 		 633 aa  1284    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  41.83 
 
 		 619 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  37.6 
 
 		 902 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  37.08 
 
 		 902 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 		 643 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  31.32 
 
 		 583 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.12 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  34.94 
 
 		 737 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 		 744 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 922 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2650  sensor protein  41.15 
 
 		 308 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.61 
 
 		 872 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.61 
 
 		 872 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.36 
 
 		 717 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 		 735 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  31.66 
 
 		 696 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  30.47 
 
 		 781 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  31.36 
 
 		 782 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 935 aa  170  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.5 
 
 		 678 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 945 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  28.43 
 
 		 865 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  29.81 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  30 
 
 		 787 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  27.79 
 
 		 1048 aa  147  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  28.24 
 
 		 783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.27 
 
 		 746 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.57 
 
 		 841 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 702 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  25.85 
 
 		 645 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  23.26 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 795 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 795 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.19 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.59 
 
 		 611 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  22.47 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  21.54 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.52 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.22 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.15 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  23.41 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  24.41 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  21.91 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.81 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.9 
 
 		 795 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  29.66 
 
 		 536 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 777 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.46 
 
 		 658 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 682 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 567 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  23.33 
 
 		 825 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.29 
 
 		 794 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  20.54 
 
 		 760 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  30.95 
 
 		 385 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.15 
 
 		 696 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3026  hypothetical protein  22.73 
 
 		 401 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  20.44 
 
 		 744 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  21.92 
 
 		 691 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  22.95 
 
 		 794 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  22.15 
 
 		 751 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 829 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.56 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  21.55 
 
 		 759 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  20.4 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  27.78 
 
 		 670 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  21.33 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.92 
 
 		 723 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  26.97 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 828 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.03 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  27.59 
 
 		 591 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  23.83 
 
 		 595 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 535 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.64 
 
 		 618 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  22.58 
 
 		 592 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 552 aa  48.5  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.38 
 
 		 723 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  30.77 
 
 		 572 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 556 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.1 
 
 		 758 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  27.47 
 
 		 573 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  22.59 
 
 		 759 aa  47.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3489  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.06 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0416624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.71 
 
 		 869 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.31 
 
 		 656 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  20.76 
 
 		 766 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>