37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5483 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  100 
 
 		 696 aa  1400    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  34.62 
 
 		 686 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 664 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.48 
 
 		 757 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  35.4 
 
 		 902 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  35.15 
 
 		 902 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  31.66 
 
 		 633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  34.16 
 
 		 583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 735 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 643 aa  163  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 744 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 922 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 737 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 945 aa  157  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 935 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.21 
 
 		 717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  27.01 
 
 		 619 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  30.31 
 
 		 872 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  30.31 
 
 		 872 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.61 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  29.97 
 
 		 787 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  29.2 
 
 		 781 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.6 
 
 		 746 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  28.14 
 
 		 783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  28.65 
 
 		 865 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  27.72 
 
 		 782 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.15 
 
 		 841 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 702 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  25.31 
 
 		 1048 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  23.54 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 760 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 		 777 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.58 
 
 		 737 aa  47.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.29 
 
 		 758 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.21 
 
 		 597 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 		 756 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.88 
 
 		 759 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>