43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1511 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1257    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.65 
 
 		 675 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.09 
 
 		 992 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5725  hypothetical protein  33.65 
 
 		 509 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  30.77 
 
 		 897 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  28.31 
 
 		 838 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  28.45 
 
 		 859 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  30.48 
 
 		 934 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  29.49 
 
 		 1000 aa  74.7  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31 
 
 		 1523 aa  74.3  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  28.97 
 
 		 1314 aa  74.3  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  30.04 
 
 		 845 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  29.83 
 
 		 1309 aa  73.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  28.57 
 
 		 900 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  28.96 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  27.52 
 
 		 1509 aa  70.5  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 1324 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 785 aa  68.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7956  hypothetical protein  31.96 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0599296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  26.44 
 
 		 829 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1068 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1510  hypothetical protein  32.77 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 911 aa  63.9  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  29.17 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  28.7 
 
 		 843 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.79 
 
 		 1261 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.05 
 
 		 899 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0492  hypothetical protein  27.91 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00346684  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  26.79 
 
 		 849 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  24.87 
 
 		 1500 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  26.73 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  29.47 
 
 		 1056 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  27.47 
 
 		 1311 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1010 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0514  hypothetical protein  30.3 
 
 		 454 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591074  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 1326 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  25.22 
 
 		 686 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1512  hypothetical protein  29.75 
 
 		 283 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.57 
 
 		 793 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.45 
 
 		 713 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1383 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1039 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2651  hypothetical protein  30.25 
 
 		 381 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468315  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>