136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0229 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  100 
 
 		 965 aa  1916    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 767 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.38 
 
 		 672 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24 
 
 		 680 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 1424 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0226  hypothetical protein  29.68 
 
 		 345 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0353537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  23.67 
 
 		 1044 aa  97.8  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.53 
 
 		 899 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.38 
 
 		 1050 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 814 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1105 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 911 aa  92.8  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 953 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 843 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 751 aa  89  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.72 
 
 		 1228 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 1186 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 1262 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.66 
 
 		 793 aa  83.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  21 
 
 		 1039 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.66 
 
 		 822 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  24.71 
 
 		 900 aa  82  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.17 
 
 		 1125 aa  81.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 785 aa  81.3  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.48 
 
 		 1288 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  27.07 
 
 		 1500 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  21.67 
 
 		 1185 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.35 
 
 		 825 aa  78.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.23 
 
 		 1488 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.79 
 
 		 1128 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  25.4 
 
 		 897 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  24.71 
 
 		 1309 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  21.15 
 
 		 977 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  26.14 
 
 		 859 aa  74.7  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 		 568 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1523 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.04 
 
 		 1328 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 924 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1068 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 		 1324 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 568 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  24.27 
 
 		 311 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  24.56 
 
 		 934 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 284 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  24.66 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.32 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1215 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 		 1000 aa  71.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 949 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 		 1056 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.67 
 
 		 2145 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  21.43 
 
 		 1131 aa  68.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 857 aa  67.8  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 669 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 		 829 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  24.92 
 
 		 849 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.82 
 
 		 919 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1283 aa  66.6  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.88 
 
 		 1106 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  29.74 
 
 		 675 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.76 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  30.81 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.58 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.22 
 
 		 1475 aa  65.1  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 1290 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 982 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  23.23 
 
 		 838 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  26.99 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.95 
 
 		 841 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.48 
 
 		 725 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27.07 
 
 		 713 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  23.94 
 
 		 1509 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1550 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1404 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 885 aa  61.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 481 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.18 
 
 		 968 aa  58.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1383 aa  57.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.81 
 
 		 732 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 1507 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1028 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  27.92 
 
 		 1314 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  19.96 
 
 		 1040 aa  56.2  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 966 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  29.1 
 
 		 1311 aa  56.2  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  28.17 
 
 		 847 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.43 
 
 		 1036 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 1136 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 577 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.4 
 
 		 919 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  20.85 
 
 		 740 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  20.54 
 
 		 1146 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>