15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0226 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0226  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0353537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  29.68 
 
 		 965 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  34.95 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.58 
 
 		 828 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1105 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 671 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 953 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 814 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 652 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 640 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 1424 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 776 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 1004 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 462 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 857 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>